Le détective privé Niki Larson et son assistante enquête sur la disparition de la fille d'un grand magnat de la presse. Ses investigations l'emmènent sur un navire pris en otage par de sauvages criminels.
Agé de 26 ans, Eikichi Onizuka est professeur remplacant itinérant. Kaoru Kitajima est une jeune journaliste à la recherche d'un criminel ayant agressé de nombreuses femmes. Le professeur Eikichi Onizuka est son suspect numéro 1 avec ses méthodes d'enseignement peu orthodoxes..
Raïto Yagami est un lycéen japonais de 17 ans extrêmement doué, malheureusement victime d'une vie ennuyante et monotone dans ce monde qu'il décrit comme perverti par le pouvoir et l'argent. En l'an 2006, il trouve un carnet de note titré "Death Note" par terre. Le Death Note est une création de Shinigami (Dieu de la Mort) et a le pouvoir d'annihiler quiconque voit son nom écrit dedans. Raïto décide de prendre le Death Note et en devient le propriétaire dans le but d'éradiquer toute forme de mal de ce monde. Mais après la mort inexpliquée de plusieurs criminels, il devient lui-même un criminel poursuivi par la police japonaise et par un mystérieux détective nommé "L". Celui-ci découvre le secret de Raïto et s'ensuit alors un maëlstrom de péripéties dans l'intérêt de la justice.
Chise est une jeune lycéenne qui, malgré sa timidité, réussit à avouer son amour à Shuuji, un de ses camarades. Ce dernier accepte de sortir avec elle, mais il reste distant car il ne sait pas comment s'y prendre dans une relation amoureuse. Mais un jour, Shuuji se retrouve pris au cœur d'une attaque aérienne, il échappe de peu à la mort, grâce à Chise. Mais c'est une Chise transformée en arme, devant protéger le Japon de ses assaillants.
Ryuuku est un shinigami (Dieu de la mort) qui s'ennuie dans son monde. Pour se divertir, il laisse tomber dans le monde des humains son death note (carnet de la mort). Raïto Yagami en devient le propriétaire en le ramassant, c'est un jeune lycéen de dix-sept ans plus que doué. Le death note entre les mains, il souhaite créer un monde comme il l'entend. Mais tous ne sont pas du même avis. Commence un "combat d'intelligence" entre Raïto et L. Qui sortira vainqueur de ce duel ?